Fruits

Research Article

Genetic relationships between nine Annona muricata L. accessions using RAPD markers

Jennifer Browna1, Hernán Laurentína1 and Martha Dávilaa1

a1 Departamento de Ciencias Biológicas, Decanato de Agronomía, Universidad Centroccidental Lisandro Alvarado, Apartado 400, Barquisimeto, Venezuela

Abstract

Introduction. Annona muricata L. is a fruit tree species of tropical origin whose fruit, the soursop, although having great potential, is not commercially exploited enough. So there is little information on this species and, in particular, on its germplasm characterization. Consequently, the purpose of our study was to estimate the genetic variability between nine soursop accessions using the RAPD marker technique. Materials and methods. By means of RAPD analysis, using the Jaccard's coefficient, a similarity matrix was generated between nine accessions, seven of them collected in Venezuela and two in Brazil. With these, a phenogram was obtained using UPGMA clustering analysis. The ordering of the accessions was also achieved by means of a principal component analysis. Results. Seventeen RAPD fragments were obtained, of which 14 were polymorphic. Average similarity was 0.5333, and ranged from 0.2627 to 1.000. The phenogram identified two groups, equal to principal coordinates analysis. The Venezuelan accessions showed more variability when compared with the Brazilian ones (Jaccard's coefficient of 0.5038 and 0.5442, respectively). Discussion. Compared with other studies on various fruit trees, that carried out here on A. muricata underlined a great genetic variability. The situation is thus favorable to undertake in Venezuela a breeding program in this still under-exploited fruit species.

Résumé

Introduction. Annona muricata L. est une espèce végétale d'origine tropicale dont le fruit, le corossol, bien que présentant un grand potentiel, n'est pas suffisamment valorisé. Il y donc peu d'informations sur cette espèce et, en particulier, sur l'évaluation de ses ressources génétiques. Notre étude a cherché à évaluer la variabilité génétique existant parmi neuf accessions de corossol présentes au Venezuela en utilisant la technique des marqueurs RAPD (amplification de fragments de DNA). Matériel et méthodes. L'analyse par RAPD et l'utilisation du coefficient de Jaccard ont permis de produire une matrice de similitude au sein des neuf accessions analysées dont sept provenaient du Venezuela et deux du Brésil. Un phénogramme a été obtenu en utilisant une analyse typologique basée sur la méthode de groupement de paires non pondérées avec moyennes arithmétiques (UPGMA). Le classement des accessions a été également réalisé par une analyse en composantes principales. Résultats. Dix-sept fragments de DNA amplifié ont été obtenus dont 14 ont été polymorphes. La similitude moyenne a été de 0,5333 et, dans l'ensemble des mesures, elle a varié de 0,2627 à 1,000. Le phénogramme a permis d'identifier deux groupes parmi les neuf accessions, les mêmes que ceux révélés par l'analyse en composantes principales. Les accessions vénézuéliennes ont montré plus de variabilité parmi elles que lorsque comparées avec les accessions brésiliennes (coefficient de Jaccard de 0,5038 et 0,5442, respectivement). Discussion. Par rapport à d'autres études sur différents arbres fruitiers, celle effectuée ici sur A. muricata a mis en évidence une grande variabilité génétique. La situation est donc favorable pour entreprendre au Venezuela un programme d'amélioration de cette espèce encore sous-exploitée.

(Online publication November 15 2003)

Key Words:

  • Venezuela ;
  • Annona muricata ;
  • genetic variation ;
  • classification

Mots clés:

  • Venezuela ;
  • Annona muricata ;
  • variation génétique ;
  • classification

Correspondence

c1 hlaurentin@ucla.edu.ve

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